Systématique

La systématique est une discipline des sciences naturelles^[1] et de l'histoire naturelle, qui a pour objet d'inventorier tous les organismes vivants, existants ou ayant existé. Pour cela, elle doit :

1. En faire la description détaillée (anatomie, physiologie, écologie, distribution…) ;
2. Les nommer sans ambiguïté, au moyen d'un binôme (ou trinôme) latin, en fonction des règles de nomenclature ;
3. Rassembler les espèces ayant des caractères en commun à l'intérieur d'entités hiérarchisées prédéfinies : genre, famille, ordre, classe, division, règne. De tels groupes sont appelés taxons et la branche de la systématique qui s'occupe de donner ces noms est la taxinomie.

Il s'agit d'une véritable science à la base de la botanique, de la zoologie, de la mycologie. Elle est ouverte vers l'avenir, la tâche à accomplir restant immense, avec près d'un quart des espèces de phanérogames restant à découvrir, nommer, décrire, comprendre, et bien davantage encore d'insectes.

Depuis Carl von Linné (1707-1778), le naturaliste suédois fondateur de la systématique moderne, de nouvelles branches ont vu le jour, comme la phylogénie : étude des mécanismes de l'évolution, ou la biosystématique : amélioration, transformation et extension de l'aire des plantes cultivées, conservation de la biodiversité…

Éléments de définition

La systématique (1° d'emblée, automatiquement, action de faire quelque chose déterminé à l'avance, 2° Science des classifications des êtres vivants) n'est pas synonyme de taxinomie (aussi appelée taxonomie), qui s'attache à décrire et définir les taxons, mais l'un de ses prolongements.
La confusion entre les deux termes vient du fait que les taxinomistes ont de tout temps été également nommés systématiciens car, après avoir étudié et décrit des organismes, ils ont naturellement essayé de les classer à partir du bas niveau des espèces (alpha taxonomy ou « taxinomie primaire »).

Dans la pratique, le terme « systématique » désigne aussi bien la méthode utilisée (on dira par exemple la « systématique phylogénétique ») que le résultat obtenu avec cette méthode (exemple : la « systématique des Agaricales »).
Dans le sens concret de résultat, les deux sciences sont peu distinctes et souvent confondues, car pratiquées simultanément par les mêmes personnes ;
Ceux qui utilisent surtout le sens de méthode, les phylogénéticiens notamment, nomment souvent le résultat classification ou encore « taxinomie ».

Historique

Les espèces animales et végétales ont été très tôt regroupées sur la base de rapprochements anatomiques et comportementaux ou selon les ou des milieux qu'elles habitent (aquatiques par exemple).

Après l'apparition du concept de l'évolution et de la disparition d'espèces ayant antérieurement existé, la classification tend à être présentée de manière heuristique et arborescente. Certains comme le zoologiste Paul Bert au XIX^e siècle ^[2] utilisent aussi comme outil pédagogique la métaphore de l'adressage postal « en poupée russe » de type monde, continent, pays, ville, rue, maison...^[2]

Au XX^e siècle, Willi Hennig pose les fondements de la classification phylogénétique en développant le paradigme cladiste.

Évolutions récentes

• Les progrès de la génétique ont conduit à revoir le classement de certains taxons dans l'arbre phylogénétique du Vivant. Les approches systémiques et fonctionnelles de la biodiversité tendent à prendre de l'importance, mais la systématique reste fondamentale pour inventorier et pour évaluer l'évolution au sein du Vivant.
• Les progrès de l'informatique, qui ont permis de développer la bio-informatique, et du travail collaboratif (par exemple à l'origine du réseau Tela Botanica qui associe environ 28 000 botanistes francophones dans 35 pays (fin 2016)^[3].. À titre d'exemple, un logiciel d'identification (de plantes) assistée par ordinateur (IDAO ^[4]) permet à des non-spécialistes d'identifier plus rapidement une plante sans passer par une complexe clé de détermination hiérarchique, sur la base d'une méthode de type « portrait-robot » de plantes. Cela facilite l'identification des plantes par des « amateurs » (ou parataxonomistes). Il est aussi utilisé par le logiciel Pl@ntNet, développé conjointement par l'Université de Montpellier, l'INRIA, le CIRAD, l'INRA et Tela Botanica ;
• De nombreuses études basées sur des protocoles de type « Sciences citoyennes » sont en développement dans le monde.

Notes et références

Voir aussi

Bibliographie

• (fr) Bourgoin, N. Léger et V. Malécot (coord.); REVUE/ Biosystema n^o 26; publication annuelle de la Société Française de Systématique, 22 novembre 2010, en ligne avec Tela Botanica, à la suite des journées annuelles de la SFS. Ce numéro traite de la Systématique et des collections.
• (fr) Guillaume Lecointre (coord.), Dossier « Systématique : réorganiser le vivant », Biofutur, N°328, Janvier 2012.
• (fr) Spichiger, Rodolphe-Édouard et al. - Botanique systématique avec une introduction aux grands groupes de champignons. - 4e édition entièrement revue et augmentée. - Lausanne: Presses polytechniques et universitaires romanes (PPUR), 2016. - x, 448p. - (ISBN 978-2-88915-134-9).
• (fr) Simon Tillier (dir.), Systématique : ordonner la diversité du vivant, avec la collaboration, pour les sciences de la Terre, de Patrick De Wever, coll. « Rapports sur la science et la technologie de l’Académie des sciences » n°11, Éditions Tec & Doc, Paris, xxx + 257 p. (ISBN 2-7430-0432-0)

Articles connexes

Liens externes

• "Vivant, la fin d’un règne ?", La Méthode Scientifique, France Culture, 25 mars 2019
• Sélection de sites web sur la systématique et l’évolution dans le répertoire encyclopédique : Les Signets de la Bibliothèque nationale de France

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